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如果我們觀察到保留時(shí)間漂移，首先應(yīng)考慮色譜柱是否已用流動(dòng)相完全平衡。通常平衡需要10-20個(gè)柱體積的流動(dòng)相，但如果在流動(dòng)相中加入少量添加劑（如離子對(duì)試劑）則需要相當(dāng)長的時(shí)間來平衡色譜柱。

固定相是否穩(wěn)定也是保留時(shí)間漂移原因之一，固定相的穩(wěn)定性都是有限的，即使在推薦的PH范圍內(nèi)使用，固定相也會(huì)慢慢水解。例如，硅膠基質(zhì)在pH4時(shí)水解穩(wěn)定性更好。水解速度與流動(dòng)相類型和配體有關(guān)。雙官能團(tuán)配體和三官能團(tuán)配體比單官能團(tuán)配體的鍵合相要穩(wěn)定；長鏈鍵合相比短鏈鍵合相穩(wěn)定；烷基鍵合相比氰基鍵合相穩(wěn)定的多。

其他硅膠基質(zhì)鍵合相在高比例水溶液環(huán)境中也可以發(fā)生水解，如氨基鍵合相等。

流動(dòng)相組成的緩慢變化也是保留時(shí)間漂移的常見原因。如流動(dòng)相中易揮發(fā)組分的揮發(fā)及循環(huán)使用流動(dòng)相等。流動(dòng)相污染也可能是原因之一。溶于流動(dòng)相中的少量污染物可能慢慢富集到色譜柱上，從而造成保留時(shí)間的漂移。建議及時(shí)更換新的流動(dòng)相。

當(dāng)反相填料色譜柱使用接近1OO%的水為流動(dòng)相時(shí)，有時(shí)會(huì)發(fā)生分離突然喪失及被分析物質(zhì)保留明顯降低或完全不保留的現(xiàn)象，這就是疏水坍塌。此現(xiàn)象是由流動(dòng)相不浸潤固定相表面而致。當(dāng)色譜柱出現(xiàn)疏水坍塌也是保留時(shí)間漂移的常見原因。常規(guī)的C18柱已經(jīng)可以在95%左右的水相環(huán)境下正常使用而不發(fā)生疏水塌陷現(xiàn)象。純水中使用，則建議使用經(jīng)過修飾改性的專用耐水柱進(jìn)行實(shí)驗(yàn)（例如月旭的Ultimate^? AQ-C18)。

保留時(shí)間漂移的另一個(gè)常見原因是色譜柱污染。如方法已經(jīng)建立，在開始時(shí)沒問題，在使用一段時(shí)間后出現(xiàn)這個(gè)問題，可能是由于色譜柱污染引起的。這時(shí)需要對(duì)色譜柱加強(qiáng)沖洗，即使用比方法流動(dòng)相更強(qiáng)的溶劑沖洗色譜柱。也可以在檢測(cè)樣品基質(zhì)比較臟時(shí)提前加保護(hù)柱。

如果泵或者管路中有氣泡，保留時(shí)間會(huì)前后漂移，可通過排氣等將氣泡趕出。泵單向閥中的寶石球磨損，造成流動(dòng)相倒流，壓力不穩(wěn)定，保留時(shí)間會(huì)前后漂移。解決辦法是更換部件。泵比例閥控制失靈，不同流路流動(dòng)相比例不斷變化，保留時(shí)間會(huì)前后漂移。解決方法是更換部件。泵活塞桿密封墊老化，流動(dòng)相滲漏。解決辦法是換密封墊。在線混合器混合能力變差，不接梯度測(cè)試混合能力，并同手工配置流動(dòng)相比較。